电子发票的兴起，让会计的报销工作更加的复杂麻烦：

电子发票与纸质发票混用，让会计处理报销票据的时候需要花更多的时间去整理才能正常保管。

电子发票需要打印报销，一般采用的是普通A4纸黑白打印，打印出来的发票文件与普通图片打印无异。所以存在篡改发票的信息后进行打印报销。逼得会计不得不花更多的时间去查验发票的真伪（很多资深财务人员，面对纸质发票，一摸一问都能辨别真伪，但是这套对电子发票毫无用处）。

最难的问题就是重复报销了，相对于篡改报销，财务人员还可以去官网查验真伪，重复报销这事就只能会计各显神通了。

比如要报销人员自证清白的（无异于掩耳盗铃），比如自己手工制作Excel台账的（慢），比如直接上无纸化报销平台的（贵），或者大多人使用的电子发票查重工具，通过手机扫发票二维码自动识别发票基础信息来自动进行查重和登记，并将台账导出成Excel的。